San Antonio de los Baños fue siempre cabecera de su término municipal. Poco después de su fundación era cabecera del Partido de su nombre. Tenía por límites: al norte la laguna, al sur la costa entre Guanímar y Cajío, al este el río Govea y al oeste el río Capellanía. Quedaban dentro de su territorio Güira de Melena, Alquízar, Vereda Nueva, Ceiba del Agua y Govea.
El corral de Alquízar fue cedido al capitán general Sancho de Alquízar en febrero de 1617. Pretendió fomentar un cafetal con 100 negros esclavos que le compró a Don Antonio Rodríguez Elvás, pero poco lo pudo disfrutar, pues murió en de junio de 1619, aunque su nombre quedó. A mediados del siglo 18 se empezó a formar un caserío muy disperso, que por Real Cédula en junio de 1775 es incorporado a Santiago de las Vegas.
El obispo Tres Palacios hizo edificar una iglesia que fue erigida en parroquia auxiliar de la de San Antonio y motivó que comenzaran a su alrededor las construcciones. La iglesia se bendijo el 16 de marzo de 1799, bajo la advocación de San Agustín.
En Alquízar fue creada la Comandancia de Armas en el año 1826. Este lugar fue residencia del capitán. La población para el año 1827 era de 670 habitantes. El 14 de junio de 1839 se segregaba de Santiago de las Vegas y se anexaba a San Antonio como barrio rural. Más tarde se redujo el territorio de San Antonio y se separa a Alquízar. Esta fue una región muy rica, con cafetales y varios trapiches azucareros.
