El Ayuntamiento se creó por disposición del Rey en la Cédula de Fundación de la Villa el 22 de septiembre de 1794. El día de la fundación del Ayuntamiento se dio a conocer quienes ocuparían los cargos de justicia mayor, el alcalde, los regidores, el aguacil mayor y el alcalde provincial de Santa Hermandad.

La primera sesión del Ayuntamiento se celebró catorce días después de ser creada pues el primer alcalde de la Villa se encontraba muy enfermo el día que se constituyó la Casa Consistorial, como también se le llamó a esta entidad. José Antonio Morejón y Cepero nació en la Habana en 1729. Al momento de ser nombrado Primer Alcalde de la Villa ocupaba el cargo de Capitán Padáneo en Ceiba del Agua. Estos capitanes eran una especie de alcaldes de barrios que gobernaban una región donde solo podían conocer asuntos de poca importancia. También se desempañaban como jueces y tenían la atribución de realizar juicios sin tribunal por causas leves. Además podían iniciar procesos penales a nivel de barrio para luego ser elevados a tenientes gobernadores. Cuando José Antonio fue elegido para el cargo tenía experiencia en mantener el orden y la disciplina.

El cargo de Capitán Padáneo que ocupaba José Antonio en el poblado de Ceiba del Agua le fue cedido a uno de sus hijos quien mantuvo las disposiciones de su padre. Otro de los Hijos del Primer Alcalde de la Villa, el presbiterio Manuel Morejón y Sotolongo, ocupó el cargo de Primer Teniente Cura de la iglesia de la Villa en 1784.